接到報告后，省衛生廳立即抽調有關單位骨干組成流調組，并于當日下午對有關情況進行了初步調查。據醫院介紹，今年上半年該院共收治患腎結石患兒16例，不包括門診治療病例，月齡大多為5-11個月，病兒病情重，部分患兒已發展為腎功能不全。據醫生反映，從前患腎結石多為成人，兒童尤其是嬰兒患此病較少。
聽了初步調查情況匯報后，省衛生廳領導對此高度重視，立即向衛生部做了匯報。衛生部對此事也非常重視，要求開展流行病學調查，盡快查明原因。省衛生廳召集流行病學、營養學和臨床專家召開了2次工作研討會，對嬰兒泌尿結石病因、診斷和流行病學調查方法及有關事項進行了研討；安排省級以上醫院對2006—2008年的病例進行檢索。目前全省共上報病例59人，死亡1人，分布在10個市州的24個縣區，以農村患兒為多。2006年和2007年未報告病例。
同時，省衛生廳安排衛生監督機構對三鹿牌配方奶粉的衛生條件、檢測能力等情況進行了衛生監督檢查，對配方奶粉采樣后送國家某單位檢測，目前樣品還在檢驗之中；安排衛生監督機構對患兒食用的奶粉進行采樣，共采樣6份，已送國家某單位檢測；安排疾病預防控制機構制定流調方案，開展流行病學調查。方案在征得省內專家意見的基礎上，報衛生部征求了專家意見，據此方案進行了修訂。之后，疾病預防控制機構開展流行病學調查，結果還在統計核對之中，目前還不能確定與配方奶粉有直接關系；邀請衛生部派專家對調查工作進行了現場考察和指導，專家認為病因復雜，為多環節、多因素所致，目前對流調方案正在進行修訂，隨后衛生廳將根據方案繼續下一步調查。
記者在解放軍第一醫院采訪了5位病兒父母。據稱，這些病兒分別來自甘肅岷縣、武山、古浪等縣農村，剛生下來就食用三鹿牌配方奶粉。這種袋裝的奶粉價格相對較低廉，是廠家專門針對農村地區推出的產品，每400克一般為18元左右，幾乎是當地農村新生兒父母的首選。但是，食用幾個月后，部分小孩出現小便困難等癥狀。經醫院診斷，患上了腎結石，且多數為雙腎結石。
這些病兒的父母為治療孩子的病，四處奔波，輾轉多個醫院，分別花了幾千到一兩萬元不等的醫療費，均感到經濟壓力很大。如武山縣高樓鄉女嬰李金霞的父母為了給孩子治病，花3500元包車從自己打工的內蒙古包頭市趕到蘭州。目前，孩子已經動了2次手術，花掉了17000多元錢，還不知道何時能出院。
記者在這些患兒的病房看到，所有父母已經用雀巢或其他品牌的奶粉代替了三鹿奶粉。雖然雀巢奶粉每900克要125元錢，父母們很心疼，但想著孩子受過的苦難，他們還是毫不猶豫地買下。一些患兒父母對記者說，希望能盡快查清病因，并請有關部門或企業幫助解決孩子的醫療費。
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