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2011年08月11日17:25 | 中國(guó)發(fā)展門戶網(wǎng) www.chinagate.cn | 給編輯寫信 字號(hào)：T|T

　　中國(guó)發(fā)展門戶網(wǎng)8月11日電 日前，中國(guó)科學(xué)院編寫了《中國(guó)科學(xué)院信息化發(fā)展報(bào)告2011》，在其中介紹了中科院超算環(huán)境特點(diǎn)及成效。具體內(nèi)容如下：

　　1.引領(lǐng)國(guó)內(nèi)大規(guī)?？茖W(xué)計(jì)算應(yīng)用

　　從中國(guó)國(guó)家網(wǎng)格各節(jié)點(diǎn)及應(yīng)用來看，中科院超算總中心作為國(guó)家網(wǎng)格的主節(jié)點(diǎn)，截至2009年，成功運(yùn)行的千核應(yīng)用有8個(gè)。

應(yīng)用名稱	運(yùn)行核數(shù)
星系演化大規(guī)模并行程序P_widgeon	8,192
結(jié)合精確相互作用勢(shì)模型以及新型構(gòu)象取樣技術(shù)的蛋白質(zhì)折疊過程模擬	6,400
鳳凰計(jì)劃	1,024
復(fù)雜生物分子模擬和藥物虛擬篩選	4,096
流感病毒血凝素蛋白受低pH調(diào)控的計(jì)算模擬研究	1,024
盤古計(jì)劃：解析暗宇宙中的結(jié)構(gòu)形成	2,048
基于圖形處理器的復(fù)雜油氣儲(chǔ)層介質(zhì)中聲場(chǎng)的多尺度離散模擬計(jì)算研究	1,024
基于分子模擬的中藥有效成分作用的生物系統(tǒng)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建	7,200

圖表 19.千核應(yīng)用規(guī)模

　　此外，中國(guó)國(guó)家網(wǎng)格運(yùn)行管理中心發(fā)布的各節(jié)點(diǎn)單位應(yīng)用及部署情況也表明，在國(guó)家網(wǎng)格應(yīng)用的部署、移植等方面，院超級(jí)計(jì)算中心的網(wǎng)格應(yīng)用在中國(guó)國(guó)家網(wǎng)格各個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)中也居于領(lǐng)先地位。

　　2.服務(wù)社會(huì)創(chuàng)新活動(dòng)初見成效

　　中科院不斷探索科研信息化基礎(chǔ)設(shè)施的共建、共享、共用的建設(shè)與服務(wù)新模式，推進(jìn)與北京、武漢、深圳等地合作，積極為地方經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展服務(wù)，已累計(jì)為社會(huì)提供機(jī)時(shí)服務(wù)超過950萬CPU小時(shí)（至2010年6月底），涉及化工、冶金、醫(yī)藥、汽車設(shè)計(jì)、安全等多個(gè)領(lǐng)域。

　　2009年，院超級(jí)計(jì)算中心成為了首都科技條件平臺(tái)研發(fā)服務(wù)實(shí)驗(yàn)基地。截至2009年12月底，院超級(jí)計(jì)算中心服務(wù)于北京市及駐京各類企事業(yè)、科研高校，如中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中醫(yī)藥信息研究所、北京生命科學(xué)研究所、清華大學(xué)、北京航空航天大學(xué)等共計(jì)12個(gè)案例，取得了較好的社會(huì)效益和一定的經(jīng)濟(jì)效益。

　　院超級(jí)計(jì)算中心的科研人員為中醫(yī)研究所開發(fā)了并行化中藥方劑配伍程序，基于中醫(yī)科學(xué)院提供的中藥方劑配伍模型，運(yùn)用高性能計(jì)算手段，針對(duì)中醫(yī)處方數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)不同藥劑的配伍情況，加速了配伍計(jì)算過程，為研究分析中醫(yī)處方的成分、劑量及藥效提供科學(xué)性統(tǒng)計(jì)分析依據(jù)。

　　院超級(jí)計(jì)算中心利用深騰7000超級(jí)計(jì)算機(jī)，為北京生命科學(xué)研究所所做的流感病毒膜蛋白—血凝素（HA）構(gòu)象變化的分子動(dòng)力學(xué)模擬提供了千核以上模擬計(jì)算的基本條件，為研究流感病毒入侵細(xì)胞過程中的分子機(jī)制以及新型廣譜抗流感藥物的設(shè)計(jì)與開發(fā)提供了重要的支撐。

　　院超級(jí)計(jì)算中心目前正積極組織人力針對(duì)美國(guó)財(cái)富500強(qiáng)企業(yè)SMITH INTERNATIONAL, INC.下屬的史密斯鉆井設(shè)備（常州）有限公司北京第二分公司的核心知識(shí)產(chǎn)權(quán)—勘探模擬軟件進(jìn)行改進(jìn)，幫助其找到適合該軟件的硬件平臺(tái)，制定軟件改進(jìn)方案，其中包括改進(jìn)并行算法、并行實(shí)現(xiàn)方法優(yōu)化（通信優(yōu)化）、代碼優(yōu)化（提高CACHE命中率）等多個(gè)方面，并正在籌劃進(jìn)一步合作洽談。

　　此外，院超級(jí)計(jì)算中心正在積極努力為北京長(zhǎng)城華冠汽車技術(shù)開發(fā)有限公司提供穩(wěn)定、高效、安全的高性能計(jì)算服務(wù)，計(jì)劃通過與CAE軟件結(jié)合、以工作流方式，為華冠汽車提供軟、硬件平臺(tái)的一攬子服務(wù)解決方案。

　　3.超算應(yīng)用服務(wù)專業(yè)化初步顯現(xiàn)

　　經(jīng)過多年的積累，并依托超級(jí)計(jì)算中心的超級(jí)計(jì)算機(jī)、院超級(jí)計(jì)算環(huán)境，我們已可為用戶提供及時(shí)、高效、準(zhǔn)確的計(jì)算機(jī)時(shí)服務(wù)；為化學(xué)、生物學(xué)、大氣科學(xué)、地學(xué)、天體物理、可視化和工業(yè)計(jì)算等學(xué)科領(lǐng)域提供服務(wù)的專業(yè)化技術(shù)團(tuán)隊(duì)已初具規(guī)模。通過建立VIP用戶服務(wù)機(jī)制，實(shí)現(xiàn)了服務(wù)的標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化和價(jià)格體系化，向打造超級(jí)計(jì)算機(jī)時(shí)服務(wù)的專業(yè)化品牌而努力。

　　在一年一度的高性能計(jì)算培訓(xùn)的基礎(chǔ)之上，廣泛開展了計(jì)算化學(xué)、生物信息等學(xué)科的軟件使用培訓(xùn)服務(wù)，通過“請(qǐng)進(jìn)來，走出去”的方式，為廣大院內(nèi)外的科研人員提供高性能計(jì)算、學(xué)科軟件應(yīng)用的按需培訓(xùn)服務(wù)，截至2010年10月底，在北京、昆明、蘭州、大連等地共舉辦高性能計(jì)算、GPU、計(jì)算化學(xué)、生物信息等專場(chǎng)培訓(xùn)近20次，培訓(xùn)學(xué)員超過3,000人次，覆蓋院內(nèi)外單位超過100家，有力地促進(jìn)了中科院及院外各高性能計(jì)算應(yīng)用領(lǐng)域科研活動(dòng)的廣泛開展。

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