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合成生物學的內涵
合成生物學區別于其他傳統生命科學的核心,是其“工程學本質”,主要體現在兩個方面。①其“自下而上”的正向工程學“策略”。因此,元件標準化→模塊構建→底盤適配,包括對生命過程的途徑、網絡的組成及其調控的認識及“正交化生命”的設計與構建,是其最核心的研究內容;而人工線路(包括新一代的“代謝工程”)的構建,就是其最重要的工程化平臺。②目標導向的構(重構)建(建造)“人造生命”。因此,“自上而下”地構建“最小基因組”或“自下而上”地合成“人工基因組”,是合成生物學另一個最核心的研究內容;大片段基因組操作和改造,以及大規模、高精度、低成本?DNA?合成,是其最重要的兩大使能技術;而基因組(包括原型細胞的合成等“細胞工程”)的構建,是其最重要的工程化平臺。這兩個方向,基本抓住了合成生物學的工程化研究所包含的“定量生物學”“分子生物學”與“系統生物學”等會聚來源的本質,原則上是比較全面和準確的;當然,我們也可以在下述?3?個方向上更具體地闡述其內涵(圖1)。
圖 1 合成生物學的內涵