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我國戰略生物資源大數據及應用

發布時間:2020-01-22 10:53:42  |  來源:中國網·中國發展門戶網  |  作者:梁卓 褚鑫 曾艷等  |  責任編輯:楊霄霄
關鍵詞:生物資源,信息化,大數據


中國科學院在資源整合共享和數據管理利用方面的進展

中國科學院作為國家戰略科技力量,歷來十分重視生物資源的保存、利用與共享。在中國科學院戰略生物資源服務計劃整體框架下,依托中國科學院微生物研究所成立了中國科學院戰略生物資源信息中心。該中心以中國科學院在生物資源領域的雄厚積淀為基礎,全面整合中國植物園聯盟、國家標本館體系、全國微生物和細胞資源應用網絡、模式與特色動物實驗平臺利用聯盟、中國生物多樣性監測與研究網絡資源數據信息,旨在實現數據共享,開展數據挖掘,提升數據價值,支撐戰略生物資源領域科學研究以及社會應用。同時,該平臺通過開展戰略生物資源領域國內外信息搜集整理和分析,提供政策咨詢參考,支撐科學決策,將保存的生物遺傳資源轉化為數據資源,實現實物資源信息的高效共享服務,并為國家相關部門和國際履約提供技術支撐。

為規范和加強中國科學院戰略生物資源服務計劃的項目數據匯交工作,促進項目數據的共享,中國科學院科技促進發展局牽頭制定了《中國科學院戰略生物資源服務計劃數據管理及標準規范》,其內容包括“數據管理及匯交辦法”和“標準規范”兩部分。“數據管理及匯交辦法”對服務計劃中的數據匯交計劃、數據匯交內容、數據匯交流程、匯交數據管理、數據使用與知識產權等內容進行了明確的規定。“標準規范”部分按照不同資源類型及其子類,對需要匯交數據的詳細內容、數據格式和樣例給出了詳細的要求。為促進生物資源數據被盡可能廣泛和自由地共享和使用,實現數據的規范管理、有效利用和增值服務提供了參考和依據。

中國科學院戰略生物資源信息中心開發了我國戰略生物資源對外信息共享門戶和綜合服務平臺。作為我國重要戰略生物資源的基礎數據平臺,該平臺提供統一的檢索入口和并行綜合查詢,發揮其核心數據目錄的作用,為我國的生命科學研究以及生物技術的發展提供重要的數據支撐。依據中國科學院戰略生物資源服務計劃數據標準規范建立的在線目錄資源數據管理平臺,可以按照各個資源領域及其數據提交單位設立不同的管理權限,并可通過基于網頁方式的數據管理平臺,建立多級的數據上傳、同步和發布等功能,從而有效支撐了全院各資源領域、各資源中心的數據匯交、實時發布和在線統計。利用數據管理工具,形成了各保藏單位、工委會、總中心的三級數據匯交體系,并匯總形成中國科學院戰略生物資源目錄(圖?1)。利用該目錄,可以數據按照來源、物種、生存狀態、共享方式等多種類型進行統計,并能進行多樣化的在線檢索和數據展示。

中國科學院戰略生物資源服務網絡信息平臺致力于涵蓋中國科學院內標本館、植物園、典型培養物、實驗動物和生物多樣性監測網絡,進行整體布局和頂層設計(表?1)。該平臺建立了一系列生物資源數據的收集、保護、研究、管理與利用等基礎數據的采集、加工、處理與交換的標準規范;整合了中國科學院生物資源數據庫,徹底理清了中國科學院生物資源的家底;建立了統一的數據服務平臺和完備的數據交換與共享機制,建立了全院統一的資源目錄和信息門戶,包括各單位館藏的元數據信息、全院綜合資源目錄及信息門戶,從而提高中國科學院生物資源保護、研究與管理水平,促進戰略生物資源面向社會的應用和服務水平。



 思考及討論

在大數據的背景下,未來的生物資源研究必將朝著形成一個全方位的生物資源研究、開發與應用的網絡的方向發展,各個環節的聯系更加緊密,對數據應用也必將提出更高的要求。系統、全面、科學地搜集、整理我國生物資源信息,不僅可以將其用于生物多樣性保護和生物資源的合理開發和利用,而且可以應用到以生物學為基礎的各個方面,推動中國生命科學研究的快速發展,進而影響生物經濟的各個領域。因此,建立戰略生物資源綜合信息服務平臺不僅是基礎科學發展的客觀要求和必然趨勢,也是國民經濟和社會可持續發展的需要。隨著我國國民經濟建設的飛速發展,各行各業要求生物學家提供越來越多的生物資源信息。中國科學院戰略生物資源綜合信息服務平臺通過整體布局和頂層設計,為生物資源的系統化、集約化保存、研究和功能評價提供全方位的信息支撐;通過建立信息集成和服務平臺,向全社會開放、共享資源,凸顯生物資源對經濟社會發展的重要支撐服務作用。未來,中國科學院還將以該信息平臺為基礎,開展生物資源搜集和功能研究的廣泛的國際合作。通過開展聯合測序、數據分析等共同研究,對生物資源進行研究及功能評價,拓寬我國資源搜集渠道,為生物技術應用提供基礎。



(梁卓,中國科學院科技促進發展局;褚鑫,中國科學院重大科技任務局;曾艷,中國科學院科技促進發展局;周桔,中國科學院科技促進發展局;馬俊才,中國科學院微生物研究所。《中國科學院院刊》供稿)


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