生態功能保護區建設是統籌人與自然和諧發展，改善和提高生態環境質量的一項重大舉措和有效途徑，是有效管理限制開發主體功能區的重要手段，是符合我國現階段國情的有效生態保護形式。依據國務院《全國生態環境保護綱要》、《關于落實科學發展觀加強環境保護的決定》和《關于編制全國主體功能區規劃的意見》有關精神，日前，國家環境保護總局正式發布了《國家重點生態功能保護區規劃綱要》（以下簡稱《綱要》）。《綱要》是我國生態功能區保護的首部規范性文件，對指導我國生態功能保護區建設具有重要意義。
《綱要》指出，生態功能保護區是指在涵養水源、保持水土、調蓄洪水、防風固沙、維系生物多樣性等方面具有重要作用的重要生態功能區內，有選擇地劃定一定面積予以重點保護和限制開發建設的區域。建立生態功能保護區，保護區域重要生態功能，對于防止和減輕自然災害，協調流域及區域生態保護與經濟社會發展，保障國家和地方生態安全具有重要意義。國家重點生態功能保護區是指對保障國家生態安全具有重要意義，需要國家和地方共同保護和管理的生態功能保護區。
《綱要》強調，《國家重點生態功能保護區規劃綱要》是根據黨中央、國務院對建立生態功能保護區的要求編制的。胡錦濤總書記在2004年中央人口資源環境工作座談會上強調：“做好生態功能區劃和生態保護規劃，加大重要生態功能保護區、自然保護區建設力度，提高保護質量”。國務院《全國生態環境保護綱要》、《關于落實科學發展觀加強環境保護的決定》均明確提出，要通過建立生態功能保護區，實施保護措施，防止生態環境的破壞和生態功能的退化。《中華人民共和國國民經濟和社會發展第十一個五年規劃綱要》將重要生態功能區建設作為推進形成主體功能區，構建資源節約型、環境友好型社會的重要任務之一。
《綱要》強調，生態功能保護區屬于限制開發區，應堅持保護優先、限制開發、點狀發展的原則，因地制宜地制定生態功能保護區的財政、產業、投資、人口和績效考核等社會經濟政策，強化生態環境保護執法監督，加強生態功能保護和恢復，引導資源環境可承載的特色產業發展，限制損害主導生態功能的產業擴張，走生態經濟型的發展道路。
《綱要》要求，生態功能保護區要處理好與自然保護區、世界文化自然遺產、風景名勝區、森林公園、地質公園等各類特別保護區間的關系。在空間范圍上，生態功能保護區不包含這些特別保護區域；在建設內容上，避免重復，互相補充；在管理機制上，各類特別保護區域的隸屬關系和管理方式不變。
《綱要》提出，要以《中華人民共和國國民經濟和社會發展第十一個五年規劃綱要》明確的國家限制開發區為重點，合理布局國家重點生態功能保護區，形成較完善的生態功能保護區建設體系，建立較完備的生態功能保護區相關政策、法規、標準和技術規范體系，使我國重要生態功能區的生態惡化趨勢得到遏制，主要生態功能得到有效恢復和完善，限制開發區有關政策得到有效落實。
《綱要》明確，在生態功能保護區重點開展以下三方面工作：一是合理引導產業發展。依據資源稟賦的差異，積極發展生態農業、生態林業、生態旅游業；在中藥材資源豐富的地區，建設藥材基地，推動生物資源的開發；在畜牧業為主的區域，建立穩定、優質、高產的人工飼草基地，推行舍飼圈養；在重要防風固沙區，合理發展沙產業；在蓄滯洪區，發展避洪經濟；在海洋生態功能保護區，發展海洋生態養殖、生態旅游等海洋生態產業。同時限制高污染、高能耗、高物耗產業的發展。要依法淘汰嚴重污染環境、嚴重破壞區域生態、嚴重浪費資源能源的產業，要依法關閉破壞資源、污染環境和損害生態系統功能的企業。同時，積極推廣沼氣、風能、小水電、太陽能、地熱能及其他清潔能源，解決農村能源需求，減少對自然生態系統的破壞。二是保護和恢復生態功能。遵循先急后緩、突出重點，保護優先、積極治理，因地制宜、因害設防的原則，結合已實施或規劃實施的生態治理工程，加大區域自然生態系統的保護和恢復力度，目的是提高水源涵養能力、恢復水土保持功能、增強防風固沙功能、提高調洪蓄洪能力，改善和提高區域環境質量。三是強化生態環境監管。通過加強法律法規和監管能力建設，提高環境執法能力，避免邊建設、邊破壞；通過強化監測和科研，提高區內生態環境監測、預報、預警水平，及時準確掌握區內主導生態功能的動態變化情況，為生態功能保護區的建設和管理提供決策依據；通過強化宣傳教育，增強區內廣大群眾對區域生態功能重要性的認識，自覺維護區域和流域生態安全。
《綱要》要求，各級環境保護部門要加強部門協調。建立綜合決策機制，應積極與其他相關部門開展聯合執法檢查，嚴厲查處生態功能保護區內各種破壞生態環境、損害生態功能的行為。要科學規劃。制定重點生態功能保護區實施規劃，并將實施規劃的主要內容納入各級政府國民經濟和社會發展規劃。要建立多渠道的投資體系。研究制定生態功能保護區投融資、稅收等優惠政策，逐步建立和完善生態環境補償機制。要加強科技創新。加強資源綜合利用、生態重建與恢復等方面的科技攻關，減少資源消耗，控制環境污染，促進生態恢復。要增強公眾參與意識。充分利用廣播、電視、報刊等媒體，廣泛深入地宣傳生態功能保護區建設的重要作用和意義，動員公眾參與生態功能保護區建設。
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